吉林大学图书馆前身为东北行政学院图书馆，1946年创办于哈尔滨。1948年与哈尔滨大学图书馆合并。1952年改称东北人民大学图书馆。1958年随校名改称吉林大学图书馆。2000年6月，原吉林大学、吉林工业大学、白求恩医科大学、长春科技大学和长春邮电学院合并组成新吉林大学，原五校图书馆也随之合并。